Boston è senza dubbio uno dei centri accademici più conosciuti al mondo. E nell'area di Greater Boston c'è la celeberrima Cambridge, sede del MIT, Massachusetts Institute of Technology (fondato nel 1861) e della Harvard University (fondata nel 1782, la più antica scuola di medicina di tutti gli Stati Uniti) rispettivamente prima e terza nella graduatoria mondiale degli atenei 2020 stilata da QS World University Rankings. Inoltre, dietro alle due big della istruzione, Boston ospita altre sei università classificate a livello internazionale. Tutto ciò ha fatto sì che si creasse un centro di attività intellettuale che è valso alla città il soprannome di 'Atene d'America'. E nel 2016 Boston ha raggiunto la più alta concentrazione di università dedite alla ricerca di alto livello di tutte le principali aree metropolitane degli Stati Uniti. Ma oltre a quegli atenei che sono il top, negli States e nel mondo, Boston ha un lungo elenco di altri istituti che si possono definire di eccellenza. Si possono così segnalare 4 college junior, 15 college che principalmente rilasciano diplomi di maturità e master e 22 istituti di specializzazione. Complessivamente sono 49 gli istituti senza scopo di lucro, 3 hanno attività di lucro, 47 sono privati e infine 5 sono le istituzioni pubbliche.